以下为基地疑云看点：南森·韦斯特（塞缪尔·杰克逊 Samuel L. Jackson饰），一位素以严厉著称美军训练基地魔鬼教官，他的冷酷无情令其和学员之间的关系一向十分紧张。汤姆·哈代（约翰·特拉沃塔 John Travolta饰），一位同样对韦斯特心存怨恨的昔日门下弟子，现任美国药品管理局官员。两人因一起神秘失踪案件而联系在了一起。这宗在巴拿马丛林发生的离奇失踪事件，致使六名受训学员连同韦斯特在飓风后消失得无影无踪。哈代受命与军方调查官员朱丽娅少尉（康妮·尼尔森 Connie Nielsen饰）携手调查此事。然而随着调查的展开，仅存的两名幸存者学员丹巴（布莱恩·范·霍尔特 Brian Van Holt饰）与肯达尔（吉奥瓦尼·瑞比西 Giovanni Ribisi饰）的供词却大相径庭。越来越多的谎言与欺骗渐渐浮出水面，到底谁在说谎，真相背后又是怎么样的可怕事实？