以下为监禁星球阿米巴看点：

日本上空突然出现谜样的生命体，随机绑架地球上的女性。遭绑架的无辜女子，会全身被束缚的状态下强制受孕后送回地球。某日，水月礼的妹妹亚美惨遭不明生物掳走，为了解救心爱的妹妹，她不得不与防卫省合作，对抗谜样的浮游物体的侵略。